Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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EFEMP1Q12805 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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EFEMP1Q12805 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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EFEMP1Q12805 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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EFEMP1Q12805 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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EFEMP1Q12805 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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EFEMP1Q12805 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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EFEMP1Q12805 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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EFEMP1Q12805 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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