Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms