Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNA1Q09470 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNA1Q09470 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms