Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.4 ms