Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms