Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RELAQ04206 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RELAQ04206 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RELAQ04206 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms