Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms