Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms