Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHC1P78364 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHC1P78364 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHC1P78364 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms