Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00315P59091 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms