Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FBXW4P57775 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms