Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms