Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIMK2P53671 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms