Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPAP53621 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms