Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB5CP51148 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms