Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT6CP48668 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms