Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFTPDP35247 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFTPDP35247 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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