Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTX2P32243 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTX2P32243 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTX2P32243 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms