Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP1P29466 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms