Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms