Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms