Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CXCL2P19875 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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