Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms