Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH2P19022 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH2P19022 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms