Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCAP17252 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCAP17252 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCAP17252 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms