Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCK1P16333 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCK1P16333 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCK1P16333 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCK1P16333 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCK1P16333 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCK1P16333 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms