Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRAFP15056 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRAFP15056 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRAFP15056 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRAFP15056 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms