Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTCP00480 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTCP00480 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTCP00480 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTCP00480 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTCP00480 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTCP00480 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTCP00480 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTCP00480 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTCP00480 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms