Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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