Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLGNO14967 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLGNO14967 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms