Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms