Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIT2A6NDA9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 536.9 ms