Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms