Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms