Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
V9GYV3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
V9GYV3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V9GYV3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V9GYV3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
V9GYV3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
V9GYV3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V9GYV3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
V9GYV3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
V9GYV3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
V9GYV3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
V9GYV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
V9GYV3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
V9GYV3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
V9GYV3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
V9GYV3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V9GYV3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V9GYV3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V9GYV3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
V9GYV3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V9GYV3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
V9GYV3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V9GYV3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
V9GYV3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V9GYV3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
V9GYV3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V9GYV3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
V9GYV3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
V9GYV3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
V9GYV3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
V9GYV3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
V9GYV3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
V9GYV3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
V9GYV3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V9GYV3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V9GYV3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
V9GYV3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V9GYV3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
V9GYV3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V9GYV3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
V9GYV3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V9GYV3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V9GYV3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V9GYV3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V9GYV3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
V9GYV3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V9GYV3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V9GYV3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
V9GYV3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V9GYV3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms