Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCA3PQ9Y6N3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA3PQ9Y6N3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms