Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3AQ9Y6K1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNMT3AQ9Y6K1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT3AQ9Y6K1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms