Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHLDA3Q9Y5J5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHLDA3Q9Y5J5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms