Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF6Q9Y4K3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF6Q9Y4K3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms