Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FARP1Q9Y4F1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms