Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTCL1Q9Y4B5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTCL1Q9Y4B5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTCL1Q9Y4B5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTCL1Q9Y4B5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTCL1Q9Y4B5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTCL1Q9Y4B5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTCL1Q9Y4B5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTCL1Q9Y4B5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTCL1Q9Y4B5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTCL1Q9Y4B5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTCL1Q9Y4B5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTCL1Q9Y4B5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms