Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HCC1Q9Y3T6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms