Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDD3Q9Y3P4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms