Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPB41L3Q9Y2J2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L3Q9Y2J2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms