Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3LQ9Y262 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3LQ9Y262 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3LQ9Y262 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3LQ9Y262 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3LQ9Y262 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3LQ9Y262 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3LQ9Y262 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3LQ9Y262 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3LQ9Y262 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3LQ9Y262 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3LQ9Y262 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3LQ9Y262 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms