Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIPT1Q9Y234 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIPT1Q9Y234 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIPT1Q9Y234 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIPT1Q9Y234 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LIPT1Q9Y234 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIPT1Q9Y234 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIPT1Q9Y234 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIPT1Q9Y234 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIPT1Q9Y234 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIPT1Q9Y234 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIPT1Q9Y234 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms