Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF3IP3Q9Y228 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms