Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNH4Q9UQ05 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNH4Q9UQ05 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KCNH4Q9UQ05 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH4Q9UQ05 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms