Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM33Q9UPN9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM33Q9UPN9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms