Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX6Q9UPM6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX6Q9UPM6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms